16S rRNA

16S rRNA je název ribozomální RNA, která je součástí malé podjednotky prokaryotického ribozomu. Název je odvozen od její sedimentační konstanty. Paralela k 16S rRNA u eukaryot je 18S rRNA.

Oblast genu 16S rRNA je konzervovaná a pomalu mutuje. Proto se tento gen začal využívat pro fylogenetické studie. +more Celý gen má délku cca 1500 bp. Avšak pro fylogenetiku lze využít i kratší sekvence nukleotidů uvnitř tzv. hypervariabilních regionů.

V genu 16S rRNA byla identifikována místa pro nasedání univerzálních primerů sloužících pro amplifikaci cílového úseku pomocí PCR.

Reference

Kategorie:RNA