Farmakofor

Technology

12 hours ago

Author

Albert Flores

Farmakofor je v medicíně a farmacii používaný termín, který označuje specifickou chemickou strukturu nebo funkční skupinu přítomnou v molekule léčiva, která je zodpovědná za interakce s cílovým proteinem či jiným makromolekulárním cílem. Tato interakce umožňuje léčivu vyvolat určitou farmakologickou odezvu v organismu. Farmakofor tedy slouží jako klíč k rozpoznání a uvázání léčiva ve svém cílovém místě. Farmakofor je často vyjádřen jako kolekce atomů a vazeb v molekule léčiva, které spolu tvoří specifickou trojrozměrnou strukturu. Tento koncept je základním prvkem při návrhu nových léčiv, kdy se vyhledávají látky, které mají podobný farmakofor jako již známá účinná léčiva. Farmakofor také může sloužit k popsání struktury vážečích míst na receptoru a k navržení nových molekul, které tyto místa efektivně vyhledávají a vážou se k nim.

Farmakofor (anglicky pharmacophore) je strukturální motiv (geometricky omezený funkčními skupinami) důležitý pro biologickou a převážně farmakologickou aktivitu. IUPAC definuje farmakofor jako „soubor stérických a elektronických funkcí, který je nezbytný k zajištění optimálních supramolekulárních interakcí se specifickým biologickým cílem a ke spuštění (nebo blokování) jeho biologické odpovědi“. Farmakofory jsou sadou metod souvisejících s QSAR: vytvářejí trojrozměrná uspořádání funkční skupiny, které jsou vyžadovány pro aktivitu. Farmakofory se obvykle používají k odvození vztahu mezi strukturou a aktivitou skupiny molekul. Podobně jako v případě QSAR se farmakofory tradičně používají k předpovídání pouze jedné aktivity (tj. jednoho cíle). Poprvé se o farmakoforech zmínil americký farmakolog Lemont Keir v rode 1971. farmakofor

Struktura

Typický farmakofor obsahuje hydrofóbní skupiny, aromatické kruhy, akceptory a donory vodíkových vazeb, kationty a anionty, které mohou mít umístěny v receptoru nebo na samotném ligandu.

Modelování farmakoforů

příklad farmakoforu: model benzodiazepinové místo na GABAA receptoru Modelování farmakoforem se používá v kvantitativní i kvalitativní analýze ligandů pro předpověď farmakologické aktivity hypotetických molekul. +more Modelování farmakoforů je proto nedílnou součástí objevování nových léků.

Proces modelování obvykle obsahuje tyto kroky:

* výběr tréninkové sady ligandů * konformační analýza * molekulární superpozice * abstrakce * validace

Ověřený model lze použít pro vyhledávání bioaktivních molekul z databáze s velkým počtem chemických struktur. Užívají se programy jako BUILDER a LUDI.

Virtuální screening založený na farmakoforu se využívá v identifikaci hit sloučenin (molekula která uspěla v iniciálním screeningu). Hlavní výhodou je snadnost a nenáročnost na čas. +more Odvozený model farmakoforu složí jako šablona k prohledávání velké databáze ligandů k odvození dalších molekul, které mají podobné vlastnosti.

Important

Angličtina

QSAR

Lemont Keir

Soubor:Pharmacophore-5-HT2C.svg

Léčiva

Chemické molekuly které se používají jako léčiva mají specifické vlastnosti. Požadavky pro tyto molekuly jsou netoxicita, efektivnost, stabilita (chemicky i metabolicky), rozumná rozpustnost syntetizovatelnost, možnost vhodné formulace (jako tablet, čípků, spreje. +more) a přesné uspořádání atomů, skupin v malé molekule pro interakci s jeho biologickým cílem a jeho aktivitou. Tedy molekula musí mít farmakologické parametry a vlastnosti ADMET (ADME je zkratka ve farmakokinetice a farmakologie pro „ absorpce , distribuce , metabolismu a vylučování “, a popisuje rozmístění a farmaceutické sloučeniny uvnitř organismu ).

Racionální návrh léků

Výzkum v oblasti farmaceutik se posunul dopředu a jako u ostatních odvětví vědy i u tohoto se stále více využívá elektroniky. V hlavní roli se zde vyskytuje onen farmakofor. +more Po vytvoření modelu farmakoforu, může být použit pro vyhledávání potenciálních ligandů z chemické databáze, virtuální screening, profilování ligandů, filtrování pozice, navrhování fragmentů nebo predikci farmakologických aktivit.

Odkazy

Související články

bioinformatika * chemoinformatika * návrh léčiv

Externí odkazy

Pharmacophore - an overview | ScienceDirect Topics. ScienceDirect. +morecom | Science, health and medical journals, full text articles and books. [url=://www. sciencedirect. com/topics/medicine-and-dentistry/pharmacophore * Pharmacophore in Drug Design and Discovery. The Pharma Review - Kongposh Publications [online]url=://www. kppub. com/articles/jan2011/pharmacophore_in_drug_design. html * Home - Pharmacophore. Redirecting to[/url]url=://pharmacophorejournal. com/en [online]url=://pharmacophorejournal. com/en.

[[Kategorie:Farmakologie]online]. 2020 Elsevier B. +moreV. or its licensors or contributors. [cit. 23. 01. 2020]. Dostupné z:[/url]. Dostupné z:[/url]. Copyright © 2020 [cit. 23. 01. 2020]. Dostupné z:[/url]].