Neuroinformatika

Neuroinformatika je vědní obor, zabývající se zpracováním a analýzou dat z oblasti neurověd za pomoci prostředků informatiky. Aplikací analytických a výpočetních metod jsou z dat získávány nové poznatky o funkci nervového systému, mechanizmech neurologických onemocnění atd.

Prolínání výzkumu v oblasti neurověd a informatiky je oboustranně přínosné, neboť jedné straně přináší nové - jinak obtížně získatelné - poznatky o fungování mozku, na straně druhé pak rozvoj a vývoj výpočetních metod pro analýzy a modelování.

Kromě samotné datové analýzy se neuroinformatika dále zabývá problematikou získávání, předzpracování a skladování dat, vytvářením datových úložišť a jejich integrací.

Typické úlohy Neuroinformatiky

Porovnání algoritmů pro spike-sorting na umělém signálu. +more V horní části je výřez původního signálu, níže původní aktivita modelovaných neuronů, dále pak výsledky třídění, dosažené různými algoritmy .

Spike sorting

Jednou ze základních úloh neuroinformatiky je analýza aktivity nervových buněk (neuronů), zaznamenaná pomocí mikroelektrod. Takový záznam obsahuje součet aktivity (akčních potenciálů) několika neuronů v bezprostředním okolí elektrody a velké množství šumu. +more Cílem spike-sortingu je jednak odlišit v záznamu hodnotný signál od šumu a dále roztřídit aktivitu k jednotlivým neuronům. To se obvykle provádí na základě tvaru jednotlivých akčních potenciálů a výsledkem je pak série časových údajů, odpovídajících okamžikům aktivity (tzv. "pálení") jednotlivých neuronů.

Související obory

Jakožto mezioborová disciplína souvisí neuroinformatika s řadou oborů. Mezi jinými to jsou: * Neurovědy * Informatika * Medicína * Biologie

Vědecké časopisy

Neuroinformatics Cílem časopisu je podpora rozvoje a šíření výpočetních metod v oblasti výzkumu nervového systému * Frontiers in Neuroinformatics volně přístupný časopis, věnující se všem odvětvím Neuroinformatiky * Journal of Computational Neuroscience * Neural Computation * Journal of Integrative Neuroscience * Neuron

Neuroinformatika v České republice

Vědecké týmy a projekty

Výzkumu v oblasti neuroinformatiky se věnují následující pracoviště: * Katedra kybernetiky Fakulty elektrotechnické na ČVUT v Praze * +more2C_fyziky_a_informatiky'>Ústav informatiky AV ČR.

Neuroinformatika na českých vysokých školách

Studium neuroinformatiky zahrnují následující studijní programy: * Fakulta elektrotechnická ČVUT nabízí obor Biomedicínská informatika v rámci programu Biomedicínské inženýrství a informatika * Fakulta aplikovaných věd ZČU nabízí obor [url=http://www. kiv. +morezcu. cz/cz/pro-zajemce/studijni-programy/magisterske/mdi. html]Medicínská informatika[/url] v rámci programu Inženýrská informatika.

Reference

Literatura

Neuroinformatics: An Overview of the Human Brain Project (Progress in Neuroinformatics Research Series) by Stephen H. Koslow and Michael F. +more Huerta, * Computing the Brain: A Guide to Neuroinformatics by Michael A. Arbib and Jeffrey S. Grethe, * Databasing the Brain: From Data to Knowledge (Neuroinformatics) by Steven H. Koslow and Shankar Subramaniam, * Brain Mapping: The Methods, Second Edition by Arthur W. Toga and John C. Mazziott, * Neuroscience Databases: A Practical Guide by Rolf Kötter,.

Externí odkazy

Kategorie:Bioinformatika Kategorie:Biomedicínské inženýrství Kategorie:Biostatistika Kategorie:Matematická biologie Kategorie:Komunikace