Cesko.wiki TRIM (protein)
Author
Albert FloresTRIM21 TRIM (tripartite motif-containing family) je proteinová rodina v tělech živočichů, která na N-konci obsahuje typický TRIM motif. V buňce mají široké spektrum různých fyziologických funkcí, jsou to mj. ubiquitin ligázy. Vyskytují se v cytoplazmě nebo v jádře buněk.
Struktura
Typický TRIM motif je složený z: # RING finger domény; # jednoho nebo dvou B-box zinkových prstů; #: když je přítomen jen jeden B-box, je to vždy B-box 2. typu #: když jdou přítomny dva B-boxy, B-box 1. +more typu vždy předchází B-box 2. typu # coiled-coil oblasti. Na C-konci TRIM proteinů se nachází: : (a) u TRIM proteinů skupiny 1: jedna z následujících domén: NHL a IGFLMN doména, PHD finger, MATH doména, ARF doména, EXOIII doména : (b) u TRIM proteinů skupiny 2: SPRY C-terminální doména.
Funkce
V lidském genomu se nachází kolem 60 TRIM proteinů. Enzymaticky jsou to (díky své RING finger doméně) tzv. +more RING-finger ubiquitin ligázy; díky tomu mohou regulovat široké spektrum buněčných procesů. Podobají se tím TRAF proteinům, které mají stejnou enzymatickou funkci a podobnou strukturu. Mnohé TRIM proteiny jsou indukovány interferony a umožňují časnou (neadaptivní) odpověď na virovou infekci (tzv. pattern recognition). Jisté TRIM proteiny se podílí na regulaci transkripce v jádře - díky vazbě na transkripční faktory. Některé, jako PML (TRIM19), jsou díky tomu i důležitými regulátory buněčné proliferace a diferenciace a hrají tak důležitou roli i v rakovinném bujení. Jiné se účastní regulace důležitých kroků embryonálního vývoje.