Karbodiimid
Author
Albert FloresObecný strukturní vzorec karbodiimidů, jádro funkční skupiny je zvýrazněno modře, na něj jsou navázány substituenty (R).
Karbodiimid (systematický název methandiimin) je název funkční skupiny s obecným vzorcem RN=C=NR. Látky obsahující tuto skupinu jsou výhradně umělého původu, v přírodě nebyly nalezeny. +more Příkladem je dicyklohexylkarbodiimid, používaný při syntéze peptidů. Dialkylkarbodiimidy jsou stabilní. Některé diraylkarbodiimidy vytvářejí za pokojové teploty dimery a polymery, což se nejčastěji děje u karbodiimidů s nízkou teplotou tání, které jsou za běžných podmínek kapalné. Pevné diarylkarbodiimidy jsou stabilnější, ale za přítomnosti vody mohou pomalu podléhat hydrolýze.
Struktura
rentgenové krystalografie (šedá = C, modrá = N)
Z hlediska vazeb jsou karbodiimidy isoelektronické s oxidem uhličitým. Vytvářejí celkem třirezonanční struktury:
:RN=C=NR ↔ RN+≡C-N−R ↔ RN−-C≡N+R
N=C=N jádra jsou téměř lineární, úhel vazby N=C=N je 170° a úhly vazeb C-N=C bývají 126±1°. Délky vazeb C=N jsou okolo 120 pm. +more Karbodiimidy jsou chirální, mají C2-symetrii. V důsledku nízké energetické bariéry pro rotaci molekul dochází k rychlým přeměnám na příslušné izomery, kvůli čemuž je izolace jednoho konkrétního enantiomeru karbodiimidu velmi obtížná; byla popsána příprava jednotlivých izomerů některých karbodiimidů, ovšem o její důvěryhodnosti se pochybuje.
Výchozí sloučenina methandiimin (HN=C=NH) je tautomerem kyanamidu.
Příprava
Z derivátů močoviny a thiomočoviny
Obvyklým způsobem přípravy karbodiimidů je dehydrosulfurizace derivátů thiomočoviny pomocí oxidu rtuťnatého.
:(R(H)N)2CS + HgO → (RN)2C + HgS + H2O
Karbodiimidy lze také získat dehydratací N,N'-dialkylmočovin:
:(R(H)N)2CO → (RN)2C + H2O
Jako dehydratační činidlo se používá oxid fosforečný nebo p-toluensulfonylchlorid
Z izokyanátů
Izokyanáty mohou být přeměněny na karbodiimidy za odštěpení oxidu uhličitého.
:2 RN=C=O → (RN)2C + CO2
Tato reakce je vratná; katalyzují ji fosfinoxidy.
Reakce
Ve srovnání s ostatními heteroalleny jsou karbodiimidy slabými elektrofily a s nukleofily reagují pouze za přítomnosti katalyzátorů, jako jsou kyseliny. Tímto způsobem lze například připravit guanidin. +more Jako slabé zásady se karbodiimidy vážou na Lewisovy kyseliny.
Moffattova oxidace
Karbodiimidy mohou vstupovat do Moffatových oxidací, při kterých se mění alkoholy na karbonylové sloučeniny za použití dimethylsulfoxidu jako oxidačního činidla.
:(CH3)2SO + (CyN)2C + R2CHOH → (CH3)2S + (CyNH)2CO + R2C=O
Sulfoxid a diimid se obvykle používají v přebytku.
Tvorba amidů
Při přípravě amidů z karbodiimidů dochází k vedlejším reakcím. Kyselina 1 reaguje s karbodiimidem za vzniku O-acylisomočoviny 2, což je v podstatě ester karboxylové kyseliny s aktivovanou odstupující skupinou. +more O-acylisomočovina následně reaguje s aminy, čímž se vytváří amid 3 a močovina 4.
O-acylisomočovina 2 může reagovat s dalším ekvivalentem karboxylové kyseliny 1 za tvorby acylanhydridu 5, který se může přeměnit na amid 3. Častou vedlejší reakcí je přeměna O-acylisomočoviny na nereaktivní N-acylmočovinu 6. +more Použitím rozpouštědel s nízkou relativní permitivitou, jako jsou dichlormethan a chloroform, lze tyto vedlejší reakce omezit.
The reaction mechanism of amide formation using a carbodiimide
Ostatní reakce
Sloučeniny obsahující karbodiimidové skupiny se používají v organické syntéze jako dehydratační činidla, nejčastěji při přeměně karboxylových kyselin na amidy a estery. Za účelem zvýšení výtěžnosti a omezení vedlejších reakcí se někdy do reakční směsi přidávají další látky, jako jsou například N-hydroxybenzotriazol nebo N-hydroxysukcinimid.
Tvorba amidů karboxylových kyselin za použití karbodiimidu
Polykarbodiimidy je nožné použít jako zesíťovací činidla u některých pryskyřic, jako jsou polyuretany a polyakryláty. Polykarbodiimid zde reaguje s karboxylovými skupinami, které jsou v takových pryskyřicích časté, za tvorby N-acylmočoviny. +more Tato reakce vede ke vzniku kovalentních vazeb mezi molekulami polymeru a vzniku síťovité struktury.
Příklady
Dicyklohexylkarbodiimid
Strukturní vzoec dicyklohexylkarbodiimidu
Dicyklohexylkarbodiimid (DCC) je jedním z prvních karbodiimidů používaných v chemických reakcích. Používá se na přípravů amidů a esterů, například při syntéze peptidů. +more K jeho výhodám patří vysoké výtěžnosti reakcí sloužících k přípravě amidů. Nevýhodami jsou tvorba N,N'-dicyklohexylmočoviny jako vedlejšího produktu, který lze odstranit filtrací, ovšem stopová množství nečistot se odstraňují obtížně. Navíc je DCC silný alergen.
Diisopropylkarbodiimid
Strukturní vzoec isopropylkarbodiimidu
Isopropylkarbodiimid (DIC) je kapalina, jejíž hydrolýzou vzniká N,N'-diisopropylmočovina, rozpustná v organických rozpouštědlech.
EDC
1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)karbodiimid (EDC) má široké možnosti využití; kromě těch uvedených u DCC a DIC jde například o to, že může být použit jako zesíťovací činidlo v biochemii.