Rhizosféra (z řečtiny rhizo-: kořenový) v ekologii označuje oblast povrchu a nejbližšího okolí kořenů rostlin, popřípadě i půdu, která je jimi prostoupena a ovlivněna (odsáváním, vyměšováním). Někdy se do tohoto pojmu zahrnují i půdní mikroorganismy, kterým tato oblast poskytuje prostředí a specifické podmínky.