Palindrom (genetika)

Plastidová DNA má typické oblasti IR Palindrom je v genetice sekvence nukleové kyseliny (DNA nebo RNA, která je stejná, pokud se čte od 5' konce k 3' konci jednoho vlákna a od 5' konce k 3' konci na komplementárním vlákně (viz direkcionalita a příklad v textu)). Sekvence rozeznávaná restrikčními endonukleázami jsou často palindromické.

Příklad palindromické sekvence: 5'- G A A T T C -3' 3'- C T T A A G -5'

Jako palindrom se někdy nepřesně označuje také invertovaná repetice (inverted repeat, z angl. inverted-obrácený a repeat-opakování), někdy zkráceně IR, tedy sekvence nukleotidů (v DNA či RNA), která je komplementární k jiné sekvenci, ale pořadí bází je zrcadlově obrácené. +more Příkladem je řetězec:.

---CCTGCXXXXXXXGCAGG---

který může vytvářet vlásenku následující podoby:

---C G--- C G T A G C C G X X X X X X X

Invertované repetice je možné najít na koncích řetězce transpozonů, v určité části plastidové DNA, ale také v místech, kde může docházet k párování bází mezi řetězci.

Reference

Kategorie:Genom