Doména (biologie)

Technology
12 hours ago
8
4
2
Avatar
Author
Albert Flores

Fylogenetický strom zachycující tři domény života Doména nebo také nadříše (či zřídka impérium) je obvykle nejvyšší používaná taxonomická kategorie (vyjma někdy užívané superdomény Neomura).

Počet domén

Podle třídoménového systému se rozeznávají tři domény, základní větve života: * archea (Archaea, postaru Archaebacteria) * bakterie (Bacteria, postaru Eubacteria) * eukaryota (Eukaryota, též Eukarya, česky též někdy jaderní).

Stávající hypotézy o původu života a jejich podpůrné analýzy zatím nedokážou spolehlivě určit, které z domén lze jednoznačně považovat za fylogeneticky nepřirozené, v žádné z hypotéz však nevznikly z posledního společného předka všechny tři jejich vývojové linie nezávisle na sobě. Přirozenost je nejvíce zpochybňována u archeí, neboť mnohé analýzy podporují představu, že eukaryota se odvětvují uvnitř nich. +more Odtud plyne i nízká podpora pro případné vyšší taxony; jako nadějnější se v současnosti jeví hypotéza přirozené skupiny Neomura (sdružující Archea a Eukaryota), naopak jako málo pravděpodobná přirozenost dříve upřednostňovaných prokaryot (Prokaryota, česky též prvojaderní, jakožto skupina sdružující archea a bakterie, tedy organismy bez pravého buněčného jádra).

Přibližně od r. 2010 se mluví (zatím hypoteticky) o čtvrté doméně. +more Tvoří ji (nebo pozůstatek po ní) skupina jaderně-cytoplazmatických virů s velkou DNA označovaná NCLDV (z anglického nucleocytoplasmic large DNA viruses). Velký genom virů rodu Mimivirus jako typických zástupců skupiny umožnil provést molekulárně biologické srovnání s ostatními doménami, poskytující indicie pro fylogenetické vyčlenění této domény. Existence nové domény je zatím přijímána skepticky. Existují i studie naznačující, že dosud neznámých domén (s pozůstatky ve formě virů) by mohlo být více.

Někdy se pojem domény používá jako formální kategorie bez fylogenetického obsahu, což umožňuje do čtvrté domény zařazovat např. hypotetické předky eukaryotické buňky („Urkaryotes“), z nichž vznikla eukaryotická buňka teprve endosymbiózou mitochondrie.

Původ názvu

Taxon „doména“ poprvé zavedli v roce 1990 vědci Carl Woese, Otto Kandler a Mark Wheelis, a to ve své studii Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.

Slovo doména pochází z latinského dominium, jež odpovídá významu slov „vlastnictví“, „držení“, ale též „vláda“ a „panství“.

Srovnání tří domén života

Tři základní domény života některé své rysy sdílejí a některé se naopak liší. Následující tabulky uvádí některé významné rozdíly a podobnosti mezi třemi fundamentálními skupinami života.

fylogenetické postaveníasi nezávislá skupinablízko k eukaryotůmblízko k archeím
rozmnožovánínepohlavnínepohlavnínepohlavní i pohlavní
výživaautotrofie (foto či chemo), heterotrofie (foto či chemo)chemoautotrofní či chemoheterotrofníobligátně chemoheterotrofní či obligátně fotoautotrofní

velikost buněkčasto 10× menší než u eukaryotčasto 10× menší než u eukaryotčasto 10× větší než u ostatních domén
typ buněkprokaryotickýprokaryotickýeukaryotický
pravé buněčné jádroNENEANO
typ ribozomů70S70S80S
stavební látka bičíkůflagelinflagelintubulin
přítomnost membránou obalených organel (systém vnitřních membrán)NENEANO
přítomnost cytoskeletujen v menší mířejen v menší mířeANO
peptidoglykan v buněčné stěněANONENE
vazba na lipidech v cytoplazmatické membráněesterová vazbaetherová vazbaesterová vazba

chromozomzpravidla cirkulární (vzácně lineární)cirkulárnívíce lineárních
přítomnost intronů (nekódující DNA)zřídkau některých genůANO
přítomnost nukleozomů a histonů na chromozomechNEANOANO
přítomnost operonů v genomuANOANONE

přítomnost transkripčního faktoru TBPNEANOANO
počet RNA polymerázjednavícevíce
mRNA nesoucí informaci pro syntézu více proteinůANOANONE
start kodonN-formylmethioninmethioninmethionin (ale v plastidech a mitochondriích formylmethionin)

Poznámky

Reference

5 min read
Share this post:
Like it 8

Leave a Comment

Please, enter your name.
Please, provide a valid email address.
Please, enter your comment.
Enjoy this post? Join Cesko.wiki
Don’t forget to share it
Top