Array ( [0] => 15610229 [id] => 15610229 [1] => cswiki [site] => cswiki [2] => Lokiarchaeota [uri] => Lokiarchaeota [3] => Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum SEM.jpg [img] => Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum SEM.jpg [4] => [day_avg] => [5] => [day_diff] => [6] => [day_last] => [7] => [day_prev_last] => [8] => [oai] => [9] => [is_good] => [10] => [object_type] => [11] => 1 [has_content] => 1 [12] => [oai_cs_optimisticky] => ) Array ( [0] => {{Taxobox [1] => | název kurzívou = ano [2] => | jméno = Lokiarchaeota [3] => | obrázek = Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum SEM.jpg [4] => | velikost obrázku = 270px [5] => | popisek = snímek Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum pořízený SEM metodou [6] => | doména = [[archea]] (Archaea) [7] => | kmen = '''Lokiarchaeota''' [8] => | rod = ''candidatus'' '''''Lokiarchaeum''''' [9] => | rod popsal = Spang et al. 2015 [10] => | říše = Proteoarchea [11] => | nadkmen = Asgard [12] => }}'''''Lokiarchaeota''''' je kmen [[Archea|archeí]], jejíž členové jsou nejbližšími známými příbuznými [[Eukaryota|eukaryot]].{{Citace periodika [13] => | příjmení = Lambert [14] => | jméno = Jonathan [15] => | titul = Scientists glimpse oddball microbe that could help explain rise of complex life [16] => | periodikum = Nature [17] => | datum vydání = 2019-08-09 [18] => | ročník = 572 [19] => | číslo = 7769 [20] => | strany = 294–294 [21] => | doi = 10.1038/d41586-019-02430-w [22] => | jazyk = en [23] => | url = https://www.nature.com/articles/d41586-019-02430-w [24] => | datum přístupu = 2022-12-30 [25] => }} Kmen zahrnuje všechny členy skupiny dříve pojmenované Deep Sea Archaeal Group (DSAG), známé také jako Marine Benthic Group B (MBG-B). ''Lokiarcheaota'' patří do nadkmene ''[[Asgard (archea)|Asgard]],'' který zahrnuje kmeny: ''Lokiarchaeota, [[Thorarchaeota]], [[Odinarchaeota]], [[Heimdallarchaeota]]'' a ''[[Helarchaeota]]''.{{Citace monografie [26] => | příjmení = Caceres [27] => | jméno = Eva F. [28] => | příjmení2 = Lewis [29] => | jméno2 = William H. [30] => | příjmení3 = Homa [31] => | jméno3 = Felix [32] => | titul = Near-complete Lokiarchaeota genomes from complex environmental samples using long and short read metagenomic analyses [33] => | url = https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2019.12.17.879148v1 [34] => | strany = 2019.12.17.879148 [35] => | doi = 10.1101/2019.12.17.879148 [36] => | poznámka = Type: article [37] => | jazyk = en [38] => }} [39] => [40] => Jeho význam vychází z fylogenetické analýzy, která prokázala existenci monofyletické skupiny složené z kmene ''Lochiarchaeota'' a eukaryot, a proto se má za to, že tento nový mikroorganismus tvoří mezikrok mezi jednoduchými buňkami prokaryot a komplexní formou eukaryot.{{Citace elektronického periodika [41] => | příjmení = Munich [42] => | jméno = Ludwig Maximilian [43] => | titul = Evolution: A revelatory relationship [44] => | periodikum = phys.org [45] => | url = https://phys.org/news/2019-12-evolution-revelatory-relationship.html [46] => | datum vydání = 2019-12-27 [47] => | jazyk = en [48] => | datum přístupu = 2022-12-30 [49] => }}{{Citace periodika [50] => | příjmení = Feltman [51] => | jméno = Rachel [52] => | titul = Newly discovered ‘missing link’ shows how humans could evolve from single-celled organisms [53] => | periodikum = Washington Post [54] => | datum vydání = 2015-05-06 [55] => | issn = 0190-8286 [56] => | jazyk = en-US [57] => | url = https://www.washingtonpost.com/news/speaking-of-science/wp/2015/05/06/newly-discovered-missing-link-called-loki-ties-us-to-our-single-celled-ancestors/ [58] => | datum přístupu = 2023-01-09 [59] => }} [60] => [61] => == Objev == [62] => Při průzkumu mikrobiální diverzity hlubin [[Severní ledový oceán|Severního ledového oceánu]] ([[Grónské moře]], hřeben Gakkel) roku 2010 byl získán vzorek sedimentu 15 km od hydrotermálního průduchu zvaného [[Lokiho hrad]]. Vzorek byl izolován ve vrtném jádře získaném z hloubky větší než 3,2 km (0,3 °C), bez známek eukaryotního života. O existenci nového kmene se výzkumníci dozvěděli na základě fylogenetických analýz pomocí sady vysoce konzervovaných genů kódujících proteiny (16S [[rRNA]]). Objev byl publikován roku 2015.{{Citace periodika [63] => | příjmení = Spang [64] => | jméno = Anja [65] => | příjmení2 = Saw [66] => | jméno2 = Jimmy H. [67] => | příjmení3 = Jørgensen [68] => | jméno3 = Steffen L. [69] => | titul = Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes [70] => | periodikum = Nature [71] => | datum vydání = 2015-05-06 [72] => | ročník = 521 [73] => | číslo = 7551 [74] => | strany = 173–179 [75] => | issn = 0028-0836 [76] => | pmid = 25945739 [77] => | doi = 10.1038/nature14447 [78] => | jazyk = en [79] => | url = http://www.nature.com/articles/nature14447 [80] => | datum přístupu = 2022-12-30 [81] => }} [82] => [83] => Navrhované pojmenování kmene ''Lokiarchaeota'' bylo navrženo s odkazem na místo odběru vzorků, Lokiho hrad{{Citace periodika [84] => | příjmení = Rincon [85] => | jméno = Paul [86] => | titul = Newly found microbe is close relative of complex life [87] => | periodikum = BBC News [88] => | datum vydání = 2015-05-06 [89] => | jazyk = en-GB [90] => | url = https://www.bbc.com/news/science-environment-32610177 [91] => | datum přístupu = 2022-12-30 [92] => }}, který nese název po severském bohovi Lokim. [[Loki]] byl popsán jako „komplexní, matoucí a ambivalentní postava''{{Citace periodika [93] => | příjmení = von Schnurbein [94] => | jméno = Stefanie [95] => | titul = The Function of Loki in Snorri Sturluson's "Edda" [96] => | periodikum = History of Religions [97] => | datum vydání = 2000-11-01 [98] => | ročník = 40 [99] => | číslo = 2 [100] => | strany = 109–124 [101] => | issn = 0018-2710 [102] => | doi = 10.1086/463618 [103] => | url = https://www.journals.uchicago.edu/doi/10.1086/463618 [104] => | datum přístupu = 2022-12-30 [105] => }}, která byla katalyzátorem mnoha diskuzí např. o jeho záměrech, povaze či dokonce pohlaví {{Citace elektronického periodika [106] => | příjmení = Scott [107] => | jméno = Jess [108] => | titul = Loki: The Story of the Trickster God [109] => | periodikum = Life in Norway [110] => | url = https://www.lifeinnorway.net/loki-norse-mythology/ [111] => | datum vydání = 2021-01-11 [112] => | jazyk = en-US [113] => | datum přístupu = 2023-01-10 [114] => }}, stejně tak obsáhlé jsou i diskuze o významu kmene ''Lokiarchaeota'', které přepisují základní teorie o raných počátcích života.{{Citace periodika [115] => | příjmení = Watson [116] => | jméno = Traci [117] => | titul = The trickster microbes that are shaking up the tree of life [118] => | periodikum = Nature [119] => | datum vydání = 2019-05-14 [120] => | ročník = 569 [121] => | číslo = 7756 [122] => | strany = 322–324 [123] => | doi = 10.1038/d41586-019-01496-w [124] => | jazyk = en [125] => | url = https://www.nature.com/articles/d41586-019-01496-w [126] => | datum přístupu = 2023-01-10 [127] => }} [128] => [129] => V roce 2019 byl úspěšně izolován a vykultivován velmi pomalu se rozmnožující člen z kmene ''Lokiarchaeota'' z hlubokomořského bahna: ''[[Prometheoarchaeum syntrophicum]]'' (referenční kmen MK-D1). Jeho buňky mají dlouhá „chapadla“, ve kterých hnízdí partnerští mikrobi, kteří mu jako „protomitochondrie“ mohli dát větší šanci na přežití s ​​přibývajícím kyslíkem během [[Velká kyslíková katastrofa|Velké kyslíkové katastrofy]], poté byly uzavřeny a endogenizovány chapadly – ​​jako předchůdci [[Mitochondrie|mitochondrií]]. {{Citace periodika [130] => | příjmení = Imachi [131] => | jméno = Hiroyuki [132] => | příjmení2 = Nobu [133] => | jméno2 = Masaru K. [134] => | příjmení3 = Nakahara [135] => | jméno3 = Nozomi [136] => | titul = Isolation of an archaeon at the prokaryote–eukaryote interface [137] => | periodikum = Nature [138] => | datum vydání = 2020-01-23 [139] => | ročník = 577 [140] => | číslo = 7791 [141] => | strany = 519–525 [142] => | issn = 0028-0836 [143] => | pmid = 31942073 [144] => | doi = 10.1038/s41586-019-1916-6 [145] => | jazyk = en [146] => | url = https://www.nature.com/articles/s41586-019-1916-6 [147] => | datum přístupu = 2022-12-30 [148] => }}{{Citace periodika [149] => | příjmení = Zimmer [150] => | jméno = Carl [151] => | titul = This Strange Microbe May Mark One of Life’s Great Leaps [152] => | periodikum = The New York Times [153] => | datum vydání = 2020-01-15 [154] => | issn = 0362-4331 [155] => | jazyk = en-US [156] => | url = https://www.nytimes.com/2020/01/15/science/cells-eukaryotes-archaea.html [157] => | datum přístupu = 2022-12-30 [158] => }} [159] => [[Soubor:Loki's_Castle_Vent_Chimney_2008-07-15.jpg|náhled|Vrchol 12 m vysokého komína hydrotermálního průduchu Lokiho hradu. Vlevo je rameno dálkově ovládaného podvodního vozidla používaného k odběru vzorků vody z Centra geobiologie Univerzity v Bergenu v roce 2008.]] [160] => [161] => == Charakteristika == [162] => Vzhledem k tomu, že byl kmen objeven [[Metagenomika|metagenomickými]] analýzami, jeho morfologické charakteristiky nejsou známy. [163] => [164] => Kompozitní genom kóduje 5381 protein-kódujících genů a jednotlivé kopie genů 16S a 23S rRNA. Mezi nimi asi 32 % neodpovídá žádnému známému proteinu, 26 % se velmi podobá archeálním proteinům a 29 % odpovídá bakteriálním proteinům. Ještě menší, ale významný podíl proteinů (175 nebo 3,3 %) je velmi podobný eukaryotním proteinům. Mezi ně patří [[aktin]], aktiny představují klíčové strukturální proteiny eukaryotních buněk a zahrnují vlákna, která jsou důležitá pro různé buněčné procesy, včetně buněčného dělení, transportu vezikul a fagocytózy. [[Fagocytóza]] je schopnost pohltit částice nebo jiné mikroby, která je nezbytná pro scénáře [[fagotrofické hypotézy]].{{Citace periodika [165] => | příjmení = Ghoshdastider [166] => | jméno = Umesh [167] => | příjmení2 = Jiang [168] => | jméno2 = Shimin [169] => | příjmení3 = Popp [170] => | jméno3 = David [171] => | titul = In search of the primordial actin filament [172] => | periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences [173] => | datum vydání = 2015-07-28 [174] => | ročník = 112 [175] => | číslo = 30 [176] => | strany = 9150–9151 [177] => | issn = 0027-8424 [178] => | pmid = 26178194 [179] => | doi = 10.1073/pnas.1511568112 [180] => | jazyk = en [181] => | url = https://pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.1511568112 [182] => | datum přístupu = 2022-12-30 [183] => }} Ta předpokládá, že eukaryotní buňka, asi před dvěma tisíci sty miliony lety, nevznikla pouhou genovou mutací (nebyl by pro ni dostatek evolučního času), ale vznikla spíše (eukaryogenezí) díky kapacitě svých prekurzorů bez jádra. Současná [[teorie sériové endosymbiózy]] (Serial Endosymbiosis Theory) spolu se svou komplementární hypotézou eocytů, nyní podpořená možným objevem ''Lochiarchaeota,'' popisuje průchod prokaryotních buněk (buď bakterií nebo archeí) do eukaryotních buněk prostřednictvím [[Symbiogenetika|symbiogenetických]] inkorporací. Tyto inkorporace jsou formy požití bez trávení, ve kterých požitý organismus nadále žije v potravě a začíná s ní udržovat [[Symbióza|symbiotický]] vztah. Jakmile je genetický materiál (symbiogenetika) vložen do hostitele a poté předán potomkům, budou se vyvíjet společně. Přítomnost aktinových proteinů a intracelulárních transportních mechanismů poskytuje důkaz o společném původu mezi kmenem ''Lokiarchaeota'' a eukaryoty. [184] => [185] => Studie genomu dále ukázaly, že s eukaryoty sdílí některé specifické proteiny, např. malé [[GTPáza|GTPasy]], části [[Ubiquitin|ubiquitinového]] systému, či komplex proteinů [[ESCRT]], který umožňuje [[Endocytóza|endocytosu]]. V eukaryotech funkce těchto sdílených proteinů zahrnují: deformaci buněčné membrány, tvorbu tvaru buňky a dynamický proteinový [[cytoskelet]]. [186] => [187] => Nepřímými metodami (měřením množství kmene ''Lokiarchaeota'' na různých místech dna a studiem tamějšího prostředí) bylo ukázáno, že je pravděpodobné, že energii získávají redukcí železa spojenou s oxidací organických látek.{{Citace periodika [188] => | příjmení = Lydvo [189] => | jméno = Steffen [190] => | titul = Investigation of the putative iron reducing capabilities of Lokiarchaeota [191] => | periodikum = Bergen open research archive [192] => | datum vydání = 2015-06-01 [193] => | url = https://bora.uib.no/bora-xmlui/handle/1956/10519 [194] => | datum přístupu = 2022-12-30 [195] => }} [196] => [197] => == Význam == [198] => [[Soubor:A_schematic_evolutionary_tree_of_the_archaea_2015_final.svg|náhled|320x320pixelů]] [199] => Srovnávací analýza genomu kmene ''Lokiarchaeota'' proti známým genomům vyústila ve fylogenetický strom podporující scénáře pro vznik eukaryot z archeálního hostitele nebo z eocyt.{{Citace periodika [200] => | příjmení = Embley [201] => | jméno = T. Martin [202] => | příjmení2 = Martin [203] => | jméno2 = William [204] => | titul = Eukaryotic evolution, changes and challenges [205] => | periodikum = Nature [206] => | datum vydání = 2006-03 [207] => | ročník = 440 [208] => | číslo = 7084 [209] => | strany = 623–630 [210] => | issn = 0028-0836 [211] => | doi = 10.1038/nature04546 [212] => | jazyk = en [213] => | url = http://www.nature.com/articles/nature04546 [214] => | datum přístupu = 2022-12-30 [215] => }}{{Citace periodika [216] => | příjmení = Lake [217] => | jméno = James A. [218] => | titul = Origin of the eukaryotic nucleus determined by rate-invariant analysis of rRNA sequences [219] => | periodikum = Nature [220] => | datum vydání = 1988-01 [221] => | ročník = 331 [222] => | číslo = 6152 [223] => | strany = 184–186 [224] => | issn = 0028-0836 [225] => | doi = 10.1038/331184a0 [226] => | jazyk = en [227] => | url = http://www.nature.com/articles/331184a0 [228] => | datum přístupu = 2022-12-30 [229] => }}{{Citace periodika [230] => | příjmení = Guy [231] => | jméno = Lionel [232] => | příjmení2 = Ettema [233] => | jméno2 = Thijs J.G. [234] => | titul = The archaeal ‘TACK’ superphylum and the origin of eukaryotes [235] => | periodikum = Trends in Microbiology [236] => | datum vydání = 2011-12 [237] => | ročník = 19 [238] => | číslo = 12 [239] => | strany = 580–587 [240] => | doi = 10.1016/j.tim.2011.09.002 [241] => | jazyk = en [242] => | url = https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0966842X11001740 [243] => | datum přístupu = 2022-12-30 [244] => }} Soubor funkcí kmene ''Lokiarchaeota'' souvisejících s membránou naznačuje, že společný předek eukaryot by mohl být přechodným krokem mezi prokaryotními buňkami, které nemají subcelulární struktury a eukaryotními buňkami, které obsahují mnoho organel. [245] => [246] => ''Lochiarcheota'' a eukaryota pravděpodobně sdílejí společného předka, pokud ano, před téměř třemi miliardami let by se rozcházely. Tento domnělý a teoretický společný předek měl mít klíčové „startovací“ geny, které umožňovaly v pozdějších fázích zvýšenou buněčnou komplexitu a nakonec vedl k evoluci eukaryot. [247] => [248] => == Odkazy == [249] => [250] => === Reference === [251] => [252] => [253] => === Externí odkazy === [254] => * {{Commonscat}} [255] => [256] => {{Taxonbar|from=Q19868361}} [257] => {{Autoritní data}} [258] => {{Portály|Biologie}} [259] => [260] => [[Kategorie:Archea]] [261] => [[Kategorie:Eukaryota]] [] => )
good wiki

Lokiarchaeota

Lokiarchaeota je kmen archeí, jejíž členové jsou nejbližšími známými příbuznými eukaryot. Kmen zahrnuje všechny členy skupiny dříve pojmenované Deep Sea Archaeal Group (DSAG), známé také jako Marine Benthic Group B (MBG-B).

More about us

About

Expert Team

Vivamus eget neque lacus. Pellentesque egauris ex.

Award winning agency

Lorem ipsum, dolor sit amet consectetur elitorceat .

10 Year Exp.

Pellen tesque eget, mauris lorem iupsum neque lacus.

You might be interested in

,'Archea','Eukaryota','Kategorie:Eukaryota','Soubor:A_schematic_evolutionary_tree_of_the_archaea_2015_final.svg','Endocytóza','Ubiquitin','Symbióza','teorie sériové endosymbiózy','Fagocytóza','Metagenomika','Asgard (archea)','Thorarchaeota'

Archea

Endocytóza

Eukaryota

Fagocytóza

Kategorie:Eukaryota

Metagenomika

Symbióza

Symbióza je biologický fenomén, který popisuje interakci dvou různých organismů, kdy oba zúčastnění partneři si navzájem poskytují určité výhody a vzájemně spolupracují.

Thorarchaeota

Ubiquitin