Nukleová báze
Author
Albert FloresPárování komplementárních bází - zde G a CNukleové báze (dusíkaté báze) jsou základní součástí nukleových kyselin. Dělí se na báze purinové (adenin, guanin) a báze pyrimidinové (cytosin, uracil, thymin).
Vytvářejí doplňkové dvojice (komplementární páry, zkratka bp), v nichž se typicky vždy 1 purinová a 1 pyrimidinová báze vzájemně vážou vodíkovými vazbami (tzv. komplementarita bází). +more Guanin se váže s cytosinem a adenin s thyminem nebo s uracilem. Tvoří kód k zápisu genetické informace. Komplementární párování pak umožňuje tuto informaci realizovat při procesech replikace, transkripce a translace.
Počet bází v genomu
Genom daného organizmu má poměrně stálý počet komplementárních párů bází (bp). Tento počet se často udává: * v kilobázích (resp. +more kbp - kilobase pair, tedy 1000 bp), * v megabázích (resp. Mbp - megabase pair, tedy milion bp) či * v gigabázích (resp. Gbp - gigabase pair, tedy miliarda bp).
Modifikované báze
Příklad modifikace bází v tRNA, která obsahuje nejvíce variant nukleových bází. +more Zde tRNAAla ze S. cerevisiae Kromě základních pěti bází je známo více než 100 modifikovaných bází. Nejběžnější z nich tvoří následující nukleosidy: * modifikace uridinu: ** ribothymidin ** dihydrouridin ** thiouridin ** pseudouridin ** methylkarbonyl * modifikace cytidinu ** 5-methylcytidin ** 5-hydroxymethylcytidin ** 5-formylcytidin ** 5-karboxylcytidin ** 2-lysylcytidin * modifikace adenosinu ** inosin ** N6-methyladenosin ** N6-isopentenyladenosin * modifikace guanosinu ** 7-methylguanosin ** queosin ** wyosin.
Nejčastější modifikované purinové báze
Nejčastější modifikované pyrimidinové báze
Nepřirozené báze
Vědcům se podařilo syntetizovat již mnoho kandidátů na nepřirozené nukleové báze, jen naprostá menšina z nich je však skutečně replikovatelná DNA polymerázami a ještě menší počet umožňuje transkripci do RNA. Pouze u jediného umělého páru nukleových bází byla dosud prokázána in vivo funkční ekvivalence s přirozenými páry (cytosin-guanin, adenin-thymin). +more Jedná se o báze "5SICS" a "NaM" (jako deoxynukleotidy značeny d5SICS resp. dNaM), které nejsou odvozeny z purinu a pyrimidinu, nýbrž obě obsahují dva kondenzované aromatické cykly.