Array ( [0] => 14904255 [id] => 14904255 [1] => cswiki [site] => cswiki [2] => Virofág [uri] => Virofág [3] => [img] => [4] => [day_avg] => [5] => [day_diff] => [6] => [day_last] => [7] => [day_prev_last] => [8] => [oai] => [9] => [is_good] => [10] => [object_type] => [11] => 0 [has_content] => 0 [12] => [oai_cs_optimisticky] => ) Array ( [0] => {{Taxobox [1] => | jméno = Virofágy [2] => | obrázek = Sputnik virofago.jpg [3] => | popisek = Virofág Sputnik [4] => | velikost obrázku = 258px [5] => | Baltimorova klasifikace virů = I [6] => | realm = ''[[Varidnaviria]]'' [7] => | říše = ''[[Bamfordvirae]]'' [8] => | kmen = ''[[Preplasmiviricota]]'' [9] => | třída = ''[[Maveriviricetes]]'' [10] => | řád = ''[[Priklausovirales]]'' [11] => | čeleď = '''''[[Lavidaviridae]]''''' [12] => | druhotné dělení = rody [13] => | podřazené taxony = [14] => * ''Sputnikvirus'' [15] => * ''Mavirus''
viz [[#Systematika|text]] [16] => }} [17] => '''Virofágy''' (z [[Latina|latinského]] ''virus'' - ''jed'' a [[Řečtina|řeckého]] ''φάγειν fágein'' - ''jíst'') jsou malé [[virus|viry]] s dvouřetězcovou DNA, které pro infekci hostitele vyžadují spoluinfekci jiného viru. Spoluinfikující viry jsou obvykle [[obří viry]]. Virofágy se při vlastní replikaci spoléhají na replikační aparát spoluinfikujícího obřího viru. Jednou z vlastností virofágů je jejich parazitický vztah vzhledem ke spoluinfikujícímu viru; jejich závislost na replikaci obřího viru často vede až k deaktivaci spoluinfikujících obřích virů. (Tím se liší od ostatních [[satelitní viry|satelitních virů]], s jednořetězcovou RNA či DNA, které jsou pro spoluinfikující viry neškodné.) Virofág tak může zlepšit zotavení a přežití hostitelského organismu. [18] => [19] => == Druhy == [20] => Dosud (polovina r. 2015) je známo přibližně 20 druhů, náležících ke čtyřem vývojovým liniím. [21] => [22] => První z virofágů, '''''[[Sputnik (virus)|Sputnik]]''''', byl objeven ve virových částicích rodu ''[[Mamavirus]]'', jehož hostitelem je [[améba]] ''[[Acanthamoeba polyphaga]]''. Jeho velikost je 50 nm, genom má 18 343 bp a 3 geny pravděpodobně patřící Mamaviru. Jeho příbuzným by mohl být čtvrtý objevený virofág, '''''[[Sputnik 2 (virus)|Sputnik 2]]''''', objevený r. 2012 ve virech ''Lentille'' příbuzných rodu ''[[Mimivirus]]'' (náleží do stejné čeledi Mimiviridae). V jeho DNA jsou totiž fragmenty známé z virofágu ''Sputnik''. Je unikátní tím, že může vsunout svou [[DNA]] do genomu svého hostitele. Obsahuje fragmenty DNA, nově nazvané transpovirony, které se chovají podobně jako [[transpozon]]y v buněčných hostitelích.{{Citace elektronického periodika [23] => | příjmení = Desnues [24] => | jméno = Christelle [25] => | příjmení2 = La Scola [26] => | jméno2 = Bernard [27] => | příjmení3 = Yutin [28] => | jméno3 = Natalya [29] => | spoluautoři = FOURNOUS, Ghislain; ROBERT, Catherine; AZZA, Saïd; JARDOT, Priscilla; MONTEIL, Sonia; CAMPOCASSO, Angélique; KOONIN, Eugene V.; RAOULT, Didier. [30] => | titul = Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses [31] => | periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [32] => | rok vydání = 2012 [33] => | měsíc vydání = říjen [34] => | den vydání = 15 [35] => | ročník = 109 [36] => | typ ročníku = svazek [37] => | číslo = 44 [38] => | strany = 18 078 – 18 083 [39] => | url = http://www.pnas.org/content/109/44/18078.long [40] => | dostupnost2 = [41] => | url2 = [42] => | issn = [43] => | doi = 10.1073/pnas.1208835109 [44] => | pmid = 23071316 [45] => | jazyk = anglicky [46] => }}YIRKA Bob: [http://phys.org/news/2012-10-giant-virus-amoeba-provirophage.html Researchers discover a giant virus in an amoeba that contains a provirophage] (popularizační článek k předchozí referenci). ''PhysOrg'', 16. říjen 2012 (anglicky)MIHULKA Stanislav: [http://www.osel.cz/index.php?clanek=6532 Divoký svět sekvencí uvnitř améby z kontaktních čoček]. O.S.E.L., 18. říjen 2012 '''''[[Sputnik 3 (virus)|Sputnik 3]]''''' byl objeven v r. 2013.{{Citace elektronického periodika [47] => | příjmení1 = Gaia [48] => | jméno1 = Morgan [49] => | příjmení2 = Pagnier [50] => | jméno2 = Isabelle [51] => | příjmení3 = Campocasso [52] => | jméno3 = Angélique [53] => | příjmení4 = Fournous [54] => | jméno4 = Ghislain [55] => | příjmení5 = Raoult [56] => | jméno5 = Didier [57] => | příjmení6 = La Scola [58] => | jméno6 = Bernard [59] => | autor1 = Gaia_2013 [60] => | titul = Broad Spectrum of Mimiviridae Virophage Allows Its Isolation Using a Mimivirus Reporter [61] => | periodikum = PLoS ONE [62] => | ročník = 8 [63] => | typ ročníku = svazek [64] => | číslo = 4: e61912 [65] => | datum_vydání = 2013-04-15 [66] => | url = https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0061912 [67] => | url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3626643/ [68] => | issn = 1932-6203 [69] => | doi = 10.1371/journal.pone.0061912 [70] => | pmid = 23596530 [71] => | jazyk = anglicky [72] => }} Do stejné vývojové linie patří i několik později objevených virofágů: '''''[[Phaeocystis globosa virus virophage]]''''' objevený v r. 2013,{{Citace elektronického periodika [73] => | příjmení = Santini [74] => | jméno = Sebastien [75] => | spoluautoři = ''et al''. [76] => | titul = Genome of ''Phaeocystis globosa'' virus PgV-16T highlights the common ancestry of the largest known DNA viruses infecting eukaryotes [77] => | periodikum = Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [78] => | rok vydání = 2013 [79] => | měsíc vydání = červen [80] => | den vydání = 25 [81] => | ročník = 110 [82] => | typ ročníku = svazek [83] => | číslo = 26 [84] => | strany = 10800–10805 [85] => | url = http://www.pnas.org/content/110/26/10800 [86] => | url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3696832/ [87] => | issn = 1091-6490 [88] => | doi = 10.1073/pnas.1303251110 [89] => | pmid = [90] => | jazyk = anglicky [91] => }} o rok později popsaný '''''[[Zamilon]]''''', parazitující na [[obří viry|obřím viru]] Mont1 (''Mimiviridae''),{{Citace elektronického periodika [92] => | příjmení = Gaia [93] => | jméno = Morgan [94] => | příjmení2 = Benamar [95] => | jméno2 = Samia [96] => | příjmení3 = Boughalmi [97] => | jméno3 = Mondher [98] => | spoluautoři = PAGNIER, Isabelle; CROCE, Olivier; COLSON, Philippe; RAOULT, Didier; La SCOLA, Bernard. [99] => | titul = Zamilon, a Novel Virophage with ''Mimiviridae'' Host Specificity [100] => | periodikum = PLoS ONE [101] => | rok vydání = 2014 [102] => | měsíc vydání = duben [103] => | den vydání = 18 [104] => | ročník = 9 [105] => | typ ročníku = svazek [106] => | číslo = 4: e94923 [107] => | strany = 1–8 [108] => | url = http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0094923 [109] => | dostupnost2 = [110] => | url2 = [111] => | issn = 1932-6203 [112] => | doi = 10.1371/journal.pone.0094923 [113] => | pmid = 24747414 [114] => | jazyk = anglicky [115] => }} '''''[[Zamilon 2]]''''', objevený v r. 2015, nebo '''''[[Miers Valley soil virophage]]''''', odhalený r. 2014 v environmentálních vzorcích z [[Antarktida|antarktické]] půdy.{{Citace elektronického periodika [116] => | příjmení = Zablocki [117] => | jméno = Olivier [118] => | příjmení2 = Zyl [119] => | jméno2 = Leonardo Joaquim van [120] => | příjmení3 = Adriaenssens [121] => | jméno3 = Evelien M. [122] => | příjmení4 = Rubagotti [123] => | jméno4 = Enrico [124] => | příjmení5 = Tuffin [125] => | jméno5 = Marla [126] => | příjmení6 = Cary [127] => | jméno6 = Stephen Craig [128] => | příjmení7 = Cowan [129] => | jméno7 = Donald A. [130] => | titul = High-Level Diversity of Tailed Phages, Eukaryote-Associated Viruses, and Virophage-Like Elements in the Metaviromes of Antarctic Soils [131] => | periodikum = Applied and Environmental Microbiology [132] => | rok vydání = 2014 [133] => | měsíc vydání = listopad [134] => | den vydání = [135] => | ročník = 80 [136] => | typ ročníku = svazek [137] => | číslo = 22 [138] => | datum přístupu = 2017-03-02 [139] => | strany = 6888–6897 [140] => | url = http://aem.asm.org/content/80/22/6888.full [141] => | url2 = https://www.researchgate.net/publication/265213821_High-Level_Diversity_of_Tailed_Phages_Eukaryote-Associated_Viruses_and_Virophage-Like_Elements_in_the_Metaviromes_of_Antarctic_Soils [142] => | issn = 1098-5336 [143] => | doi = 10.1128/AEM.01525-14 [144] => | pmid = 25172856 [145] => | jazyk = anglicky [146] => }} [147] => [148] => Druhým objeveným virofágem, ale odlišné vývojové linie než ''Sputnik'', je '''''[[Mavirus]]''''', který napadá ''[[Cafeteria roenbergensis virus]]'' (CroV), patogen dravého mořského bičíkovce ''[[Cafeteria roenbergensis]]''. Genom má 19 063 bp a obsahuje retrovirové [[integráza|integrázy]] a [[DNA polymeráza|DNA polymerázy]] B. [[Sekvence DNA]] je nejpodobnější eukaryotickým [[transpozon]]ům, což by svědčilo pro jejich virový původ. Buňky si tak zřejmě snaží pomoci v boji proti CroV. Ke stejné linii patří později (2013) objevený '''''[[Ace Lake Mavirus]]''''' (ALM).{{Citace elektronického periodika [149] => | příjmení = Zhou [150] => | jméno = Jinglie [151] => | příjmení2 = Zhang [152] => | jméno2 = Weijia [153] => | příjmení3 = Yan [154] => | jméno3 = Shuling [155] => | spoluautoři = XIAO, Jinzhou; ZHANG, Yuanyuan; LI, Bailin; PAN, Yingjie; WANG, Yongjie. [156] => | titul = Diversity of virophages in metagenomic data sets [157] => | periodikum = Journal of Virology [158] => | rok vydání = 2013 [159] => | měsíc vydání = únor [160] => | den vydání = 13 [161] => | ročník = 87 [162] => | typ ročníku = svazek [163] => | číslo = 8 [164] => | strany = 4225–4236 [165] => | url = http://jvi.asm.org/content/87/8/4225.long [166] => | issn = 1098-5514 [167] => | doi = 10.1128/JVI.03398-12 [168] => | pmid = 23408616 [169] => | jazyk = anglicky [170] => }} [171] => [172] => Třetí objevený virofág, '''''[[Organic Lake virophage]]''''' (OLV), odlišné vývojové linie než výše uvedené, byl objeven roku [[2011]] ve slaném [[Antarktida|antarktickém]] jezeře [[Organic Lake]]. Parazituje na virech ''[[Phycodnaviridae]]'', napadajících [[řasy]].{{citace elektronické monografie | url=http://www.nature.com/news/2011/110328/full/news.2011.188.html | titul='Virus-eater' discovered in Antarctic lake : Nature News | datum přístupu=2012-06-16}} Jeho průměr je ~100 nm a genom tvoří 26 421 bp. Do stejné skupiny patří i později (2013) objevené druhy skupiny '''[[Yellowstone Lake virophage]]s''' (v r. 2017 je jich známo sedm: YLSV1 až YLSV7), jejichž kompletní genomy byly získány molekulární analýzou metagenomických sekvencí odebraných z Yellowstonského jezera, jakož i '''[[Dishui Lake virophage]]s''' a '''''[[Qinghai Lake virophage]]''''', metagenomickou analýzou objevené ve vzorcích z [[Čína|východočínského]] jezera [[Dishui]] v r. 2015, resp. [[Tibet]]ského jezera [[Kukunor|Čching-chaj-chu]] v r. 2016.{{Citace elektronického periodika [173] => | autor = Chaowen Gong [174] => | autor2 = Weijia Zhang [175] => | autor3 = Xuewen Zhou [176] => | autor4 = Hongming Wang [177] => | autor5 = Guowei Sun [178] => | autor6 = Jinzhou Xiao [179] => | autor7 = Yingjie Pan [180] => | spoluautoři = SHULING YAN, YONGJIE WANG. [181] => | titul = Novel Virophages Discovered in a Freshwater Lake in China [182] => | periodikum = Frontiers in Microbiology [183] => | vydavatel = Frontiers Media SA [184] => | rok vydání = 2016 [185] => | měsíc vydání = leden [186] => | den vydání = 22 [187] => | ročník = 7: 5 [188] => | typ ročníku = svazek [189] => | datum přístupu = 2017-03-02 [190] => | url = http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2016.00005/full [191] => | url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4722103/ [192] => | doi = 10.3389/fmicb.2016.00005 [193] => | pmid = 26834726 [194] => | jazyk = anglicky [195] => }}{{Citace elektronického periodika [196] => | příjmení = Oh [197] => | jméno = Seungdae [198] => | příjmení2 = Yoo [199] => | jméno2 = Dongwan [200] => | příjmení3 = Liu [201] => | jméno3 = Wen-Tso [202] => | titul = Metagenomics Reveals a Novel Virophage Population in a Tibetan Mountain Lake [203] => | periodikum = Microbes and Environments [204] => | vydavatel = Nakanishi Printing [205] => | rok vydání = 2016 [206] => | měsíc vydání = květen [207] => | den vydání = 3 [208] => | ročník = 31 [209] => | typ ročníku = svazek [210] => | číslo = 2 [211] => | datum přístupu = 2017-03-02 [212] => | strany = 173–177 [213] => | url = https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsme2/31/2/31_ME16003/_article [214] => | url2 = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4912154/ [215] => | issn = 1347-4405 [216] => | doi = 10.1264/jsme2.ME16003 [217] => | pmid = [218] => | jazyk = anglicky [219] => }} [220] => [221] => V r. 2015 byl publikován objev nové, čtvrté vývojové linie virofágů, tzv. '''[[rumen virophages]]''' (RVP), nalezených molekulární analýzou v metagenomických sekvencích získaných ze střev ovcí. Pravděpodobně parazitují na mimivirech. Vyznačují se několika odlišnostmi ve složení a unikátní stavbou, která naznačuje, že mohly vzniknout jako [[Chimérismus|chiméry]] virofága a polintoviru.{{Citace elektronického periodika [222] => | příjmení = Yutin [223] => | jméno = Natalya [224] => | příjmení2 = Kapitonov [225] => | jméno2 = Vladimir V [226] => | příjmení3 = Koonin [227] => | jméno3 = Eugene V. [228] => | titul = A new family of hybrid virophages from an animal gut metagenome [229] => | periodikum = Biology Direct [230] => | rok vydání = 2015 [231] => | měsíc vydání = duben [232] => | den vydání = 25 [233] => | ročník = 10 [234] => | typ ročníku = svazek [235] => | číslo = 19 [236] => | strany = 1–9 [237] => | url = http://www.biologydirect.com/content/10/1/19 [238] => | dostupnost2 = PDF [239] => | url2 = http://www.biologydirect.com/content/pdf/s13062-015-0054-9.pdf [240] => | issn = [241] => | doi = 10.1186/s13062-015-0054-9 [242] => | pmid = 25909276 [243] => | jazyk = anglicky [244] => }} [245] => [246] => == Systematika == [247] => Všechny známé virofágy jsou řazeny do společné čeledi ''[[Lavidaviridae]]''. [248] => [249] => Metagenomické analýzy umožnily od r. 2008, kdy byl objeven první virofág, identifikovat již stovky virofágových genomů. Protože k nim však absentují replikující izoláty, neumožňuje být jejich objev klasifikován v [[Klasifikace virů#Systém ICTV|systému ICTV]]. Proto nadále (k r. 2019) zůstávají pouze dva uznané rody virofágů, a sice '''''Sputnikvirus''''' (se dvěma oficiálně uznanými druhy ''Mimivirus-dependent virus Sputnik'', ''Mimivirus-dependent virus Zamilon'') a '''''Mavirus''''' (s jediným oficiálně uznaným druhem ''Cafeteriavirus-dependent mavirus''), třebaže by OLV, YSLV a RVP nové rody vyžadovaly.{{Citace elektronického periodika [250] => | příjmení1 = Paez-Espino [251] => | jméno1 = David [252] => | příjmení2 = Zhou [253] => | jméno2 = Jinglie [254] => | příjmení3 = Roux [255] => | jméno3 = Simon [256] => | spoluautoři = ''et al''. [257] => | titul = Diversity, evolution, and classification of virophages uncovered through global metagenomics [258] => | periodikum = Microbiome [259] => | vydavatel = BioMed Central Ltd., part of Springer Nature [260] => | ročník = 7: 157 [261] => | typ ročníku = svazek [262] => | datum_vydání = 2019-12-10 [263] => | url = https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-019-0768-5 [264] => | url2 = https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31823797/ [265] => | issn = 2049-2618 [266] => | doi = 10.1186/s40168-019-0768-5 [267] => | pmid = 31823797 [268] => | jazyk = anglicky [269] => }} [270] => [271] => == Význam == [272] => Virofágy dokáží zprostředkovat [[Horizontální přenos genetické informace|horizontální přenos]] mezi viry, obdobně jako jiné viry mezi buňkami. Jelikož jsou pro své hostitele smrtící, slouží takřka jako pomocníci buněk v boji proti virům, které je napadají. Z hlediska léčby virových onemocnění jde o objev velice zajímavý, i když například medicínsky významné viry z čeledí [[Retroviridae]] nebo [[Orthomyxoviridae]] jsou příliš malé a nemohou proto sloužit jako hostitelé virofágů. [273] => [274] => == Odkazy == [275] => [276] => === Reference === [277] => {{překlad|en|Organic Lake virophage|464309301}} [278] => [279] => [280] => === Literatura === [281] => Lhotský, Josef. ''Úvod do studia symbiotických interakcí mikroorganismů. Nový pohled na viry a bakterie''. Praha, Academia, 2015, 208 s, s. 51-54. [282] => [283] => === Externí odkazy === [284] => * {{Commonscat}} [285] => * [http://www.osel.cz/index.php?obsah=6&clanek=3830 Sputnik ] [286] => * [http://www.osel.cz/index.php?clanek=5594 Mavirus ] [287] => * [http://www.lidovky.cz/virovy-david-a-virovy-golias-die-/ln_veda.asp?c=A080820_095908_ln_veda_svo Virofagie ] [288] => {{Autoritní data}} [289] => [290] => [[Kategorie:Viry]] [291] => [[Kategorie:Nebuněčné organismy]] [] => )
good wiki

Virofág

Virofágy (z latinského virus - jed a řeckého φάγειν fágein - jíst) jsou malé viry s dvouřetězcovou DNA, které pro infekci hostitele vyžadují spoluinfekci jiného viru. Spoluinfikující viry jsou obvykle obří viry.

More about us

About

Expert Team

Vivamus eget neque lacus. Pellentesque egauris ex.

Award winning agency

Lorem ipsum, dolor sit amet consectetur elitorceat .

10 Year Exp.

Pellen tesque eget, mauris lorem iupsum neque lacus.

You might be interested in

,'obří viry','Lavidaviridae','Antarktida','transpozon','virus','Mamavirus','Cafeteria roenbergensis virus','Latina','Řečtina','integráza','Dishui Lake virophage','řasy'

Antarktida

Integráza

Latina

Řasy

Řasy jsou jednobuněčné nebo mnohobuněčné organismy, které mohou být nalezeny ve sladkých nebo slaných vodách, na povrchu tůní nebo na suchých površích.

Řečtina

Řečtina je jazyk, který patří mezi indoevropské jazyky a je oficiálním jazykem Řecka a Kypru.

Transpozon

Virus