Array ( [0] => 15482848 [id] => 15482848 [1] => cswiki [site] => cswiki [2] => Viroid [uri] => Viroid [3] => PSTviroid.png [img] => PSTviroid.png [4] => [day_avg] => [5] => [day_diff] => [6] => [day_last] => [7] => [day_prev_last] => [8] => [oai] => [9] => [is_good] => [10] => [object_type] => [11] => 1 [has_content] => 1 [12] => [oai_cs_optimisticky] => ) Array ( [0] => {{Taxobox [1] => | jméno = Viroidy [2] => | obrázek = PSTviroid.png [3] => | popisek = Viroid vřetenovitosti hlíz bramboru (PSTV) [4] => | velikost obrázku = 300px [5] => | Baltimorova klasifikace virů = 0 [6] => | nezařazená říše = [[Virus|Viry]] (Vira, syn. Virae, Viruae, Virus)Oddělení viry. In: ''BioLib.cz'' [online]. ©1999–2023 [cit. 10. 9. 2023]. Dostupné z: https://www.biolib.cz/cz/taxon/id14776/ [7] => | realm = ''[[RNA viry|Riboviria]]'' [8] => | druhotné dělení = Čeledi [9] => | podřazené taxony = [10] => *'''''Avsunviroidae''''' [11] => *'''''Pospiviroidae''''' [12] => }} [13] => '''Viroid''' je malá infekční cirkulární autokatalytická [[ribonukleová kyselina]] ('''RNA''') nekódující žádný [[Bílkovina|protein]]. [[Hostitel]]i viroidů jsou vyšší [[rostliny]], u kterých viroidy způsobují [[Nemoc|onemocnění]] podobná [[viróza|virózám]]. Mezi časté příznaky takových chorob patří zakrslost, [[epinastie]] a žluté skvrny na listech. První objevený viroid, '''PSTV''' (angl. ''Potato Spindle Tuber Viroid'') patřící do čeledi ''Pospiviroidae'', způsobuje vřetenovitost [[brambor]]. Viroid '''cadang-cadang''' ('''CCCV''') způsobuje smrtelné onemocnění [[Kokosový ořech|kokosových]] palem na [[Filipíny|Filipínách]], které devastuje místní [[plantáž]]e. Mezi další rostliny trpící na viroidová onemocnění patří [[rajče|rajčata]], [[Chmel otáčivý|chmel]], [[citrus]]y, [[avokádo|avokáda]] a další. [14] => [15] => První viroidová onemocnění se objevila až ve dvacátém století a navíc jsou obvykle vázána na určitou lokalitu. Vysvětluje se to tím, že se viroidy vyskytují u divoce rostoucích rostlin, u kterých nezpůsobují chorobné příznaky a ze kterých se přenesly na citlivé kulturní plodiny. Viroidy se šíří pomocí [[semeno|semen]] a [[pyl]]u, ale také přes zemědělské nářadí způsobující mechanická poranění rostlinné tkáně. [16] => [17] => == Molekulární biologie == [18] => [19] => === Genom === [20] => Viroidy byly objeveny až v roce 1971, dosud bylo zjištěno, že infikují pouze rostliny. Cyklické RNA molekuly viroidů obsahují zhruba 250-400 [[nukleotid]]ů, které nekódují žádný [[Bílkovina|protein]]. Sekvence ([[primární struktura]]) kompletního [[genom]]u '''PSTV''' vypadá následovně (obsahuje 359 nukleotidů a je cirkulárně kovalentně uzavřená): [21] => [22] => 1 CGGAACUAAA CUCGUGGUUC CUGUGGUUCA CACCUGACCU CCUGAGCAGA AAAGAAAAAA [23] => 61 GAAGGCGGCU CGGAGGAGCG CUUCAGGGAU CCCCGGG'''GAA AC'''CUGGAGCG AACUGGCAAA [24] => 121 AAAGGACGGU GGGGAGUGCC CAGCGGCCGA CAGGAGUAAU UCCCGCCGAA ACAGGGUUUU [25] => 181 CACCCUUCCU UUCUUCGGGU GUCCUUCCUC GCGCCCGCAG GACCACCCCU CGCCCCCUUU [26] => 241 GCGCUGUCGC UUCGGCUACU ACCCGGUGGA AACAACUGAA GCUCCCGAGA ACCGCUUUUU [27] => 301 CUCUAUCUUA CUUGCUUCGG GGCGAGGGUG UUUAGCCCUU GGAACCGCAG UUGGUUCCU [28] => [29] => Většina známých viroidů vykazuje s genomem PSTV vysokou (více než 60%) [[Homologie (biologie)|homologii]]. Všechny známé viroidy obsahují typickou sekvenci '''GAAAC''' (tu sdílí i s [[virusoid]]y), v jejíž blízkosti se u většiny viroidů nachází '''centrální [[konzervativní sekvence|konzervativní]] oblast'''. Genom mnoha viroidů obsahuje také charakteristickou '''polypurinovou sekvenci'''. [30] => [31] => V sekundární struktuře se střídají spárované úseky s nespárovanými. Na základě výpočtů vypadá sekundární struktura PSTV takto (modře je označen první a poslední nukleotid ve výpisu sekvence genomu výše, červeně je zvýrazněna sekvence GAAAC, centrální konzervativní oblast je vyznačena žlutě): [32] => [33] => [[Soubor:PSTviroid.png|náhled|střed|800px|Pravděpodobná sekundární struktura viroidu PSTV]] [34] => [35] => Terciární struktura se v elektronovém mikroskopu jeví jako krátká tyčka, jejíž tloušťka odpovídá dvojšroubovici nukleové kyseliny. [36] => [37] => === Replikace === [38] => Viroidy se replikují v [[buněčné jádro|jádru]] buňky, nejvíce se jich nachází v [[jadérko|jadérku]]. Replikace se provádí metodou '''valivé kružnice''', tj. opakovaným přepisem cyklického viroidu do komplementární lineární multimerní RNA. Tento přepis katalyzuje buněčná [[RNA polymeráza]] II. Multimery se autokatalicky stříhají na jednotlivé monomery. Ligací monomerů vznikají ''minus'' antiviroidy, podle nichž [[RNA polymeráza]] I v jadérku syntetizuje ''plus'' viroidy. [39] => [40] => === Homologie === [41] => Centrální konzervativní oblast viroidů je homologická 5' koncové oblasti malé jaderné RNA U1, která se účastní sestřihu [[pre-mRNA]] a rozpoznávání 5' konce [[intron]]ů. Na tom je založena hypotéza o původu viroidu z vystřiženého intronu, který díky své struktuře unikl degradaci, a zároveň hypotéza o patogenním účinku interferencí se sestřihem [[pre-mRNA]] v jádře. Existují však homologie i s dalšími buněčnými sekvencemi. [42] => [43] => == Systém == [44] => Klasifikace byla navržena Floresem a kol. v r. 1998{{Citace periodika [45] => | příjmení = Flores [46] => | jméno = R. [47] => | příjmení2 = Randles [48] => | jméno2 = J. W. [49] => | příjmení3 = Bar-Joseph [50] => | jméno3 = M. [51] => | spoluautoři = DIENER, T. O. [52] => | titul = A proposed scheme for viroid classification and nomenclature [53] => | periodikum = Archives of Virology [54] => | odkaz na periodikum = [55] => | rok vydání = 1998 [56] => | ročník = 143, no. 3 [57] => | typ ročníku = vol. [58] => | číslo = [59] => | strany = 623–629 [60] => | issn = 0304-8608 [61] => | doi = 10.1007/s007050050318 [62] => | pmid = 9572562 [63] => | jazyk = anglicky [64] => }} a revidována Dienerem v r. 2001.{{Citace periodika [65] => | příjmení = Diener [66] => | jméno = T. O. [67] => | titul = The viroid: biological oddity or evolutionary fossil? [68] => | periodikum = Advances in Virus Research [69] => | rok vydání = 2001 [70] => | ročník = 57 [71] => | typ ročníku = vol. [72] => | číslo = [73] => | strany = 137–184 [74] => | issn = 0065-3527 [75] => | doi = 10.1016/s0065-3527(01)57003-7 [76] => | pmid = 11680384 [77] => | jazyk = anglicky [78] => }} [79] => [80] => Standardními příponami jsou: [81] => * pro čeleď: ''-viroidae'' [82] => * pro rod: ''-viroid'' [83] => [84] => [[Viroid]]y jsou členěny do dvou čeledí. Zástupci čeledi '''''Pospiviroidae''''' mají v [[genom]]u tzv. centrální konzervovanou oblast (CCR – central conserved region), která obsahuje „jádrové“ sekvence a má specifické sekundární struktury klíčové pro replikaci. Zástupci čeledi '''''Avsunviroidae''''' jsou zase schopni katalyzovat samoštěpení multimerů vytvářených při replikaci. [85] => [86] => Systém vypadá následovně:{{Citace periodika [87] => | příjmení = Góra-Sochacka [88] => | jméno = Anna [89] => | titul = Viroids: unusual small pathogenic RNAs [90] => | periodikum = Acta Biochimica Polonica [91] => | rok vydání = 2004 [92] => | ročník = 51, no. 3 [93] => | typ ročníku = vol. [94] => | číslo [95] => | lokace = Tabulka 1 (strana 589) [96] => | strany = 587–607 [97] => | url = http://www.actabp.pl/#File?./html/3_2004/587.html [98] => | dostupnost2 = PDF [99] => | url2 = http://www.actabp.pl/pdf/3_2004/587.pdf [100] => | issn = 1734-154X [101] => | doi = [102] => | pmid = 15448723 [103] => | jazyk = anglicky [104] => }} [105] => * Čeleď ''Avsunviroidae'' [106] => ** Rod ''Avsunviroid'' [107] => ** Rod ''Pelamoviroid'' [108] => ** Rod ''Elaviroid'' [109] => * Čeleď ''Pospiviroidae'' [110] => ** Rod ''Pospiviroid'' [111] => ** Rod ''Hostuviroid'' [112] => ** Rod ''Cocadviroid'' [113] => ** Rod ''Apscaviroid'' [114] => ** Rod ''Coleviroid'' [115] => [116] => == Viroidy škodící na kulturních rostlinách == [117] => * [[viroid PSTV]] (Potato Spindle Tuber Viroid) [118] => * [[viroid CEV]] (Citrus Exocortis Viroid) [119] => * [[viroid CCCV]] (Coconut Cadang-Cadang Viroid) [120] => [121] => == Příbuzné pojmy == [122] => Současná [[klasifikace virů#Systém ICTV|klasifikace]] zahrnuje viroidy přímo do systému virů, ale taxonům nechává specifické pojmenování s příponami rodu a čeledi ''-viroid'', ''-viroidae''. Vedle pravých virů a viroidů zahrnuje i další virům podobné částice, tzv. přenosné genetické elementy: [123] => * '''[[Virus|Viry]]''' („pravé“; pojmenování ''-virus'', ''-viridae'') se liší od viroidu tím, že kóduje proteiny, jeho viriony zahrnují [[Kapsida|kapsidu]] a některé mají místo RNA DNA. [124] => * '''[[Virusoid]]y''', systematicky nazývané „'''satelitní nukleové kyseliny'''“ (pojmenování ''-satellite'', ''-satellitidae'') se od viroidu liší tím, že je plně závislý na pomocném viru a šíří se v jeho kapsidách. [125] => * '''[[Viriformy]]''' (pojmenování ''-viriform'', ''-viriformidae'') jsou endogenní prvky odvozené z virů, které byly jejich organickými (buněčnými) hostiteli „domestikovány“, aby plnily funkce důležité pro životní cyklus hostitele. [126] => [127] => {{kotva|obelisk}}Dosud není definován taxon pro zařazení ucelené fylogenetické skupiny tzv. [[obelisk (viry)|obelisků]], popsaných teprve v r. 2024: [128] => * Jako '''obelisky''' se označují viroidům podobné entity kolonizujících [[bakterie]] lidského zažívacího traktu, představující neobalené genomy s kruhovou [[RNA]], která je větší a na rozdíl od viroidů obsahuje i sekvence kódující [[Bílkovina|protein]]y dosud neznámé rodiny („obliny“), některé z nich i se signaturou [[ribozym]]ů replikačního mechanismu podobného viroidům, nikoli však proteiny pro virový obal.{{Citace elektronického periodika [129] => | příjmení1 = Zheludev [130] => | jméno1 = Ivan N. [131] => | příjmení2 = Edgar [132] => | jméno2 = Robert C. [133] => | příjmení3 = Lopez-Galiano [134] => | jméno3 = Maria Jose [135] => | příjmení4 = de la Peña [136] => | jméno4 = Marcos [137] => | příjmení5 = Babaian [138] => | jméno5 = Artem [139] => | příjmení6 = Bhatt [140] => | jméno6 = Ami S. [141] => | příjmení7 = Fire [142] => | jméno7 = Andrew Z. [143] => | titul = Viroid-like colonists of human microbiomes [144] => | periodikum = bioRχiv [145] => | vydavatel = Cold Spring Harbor Laboratory [146] => | datum_vydání = 2024-01-21 [147] => | url = https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.20.576352v1 [148] => | datum_přístupu = 2024-01-29 [149] => | jazyk = anglicky [150] => | doi = 10.1101/2024.01.20.576352 [151] => | poznámky = preprint v1 [152] => }}{{Citace elektronického periodika [153] => | příjmení1 = Pennisi [154] => | jméno1 = Elizabeth [155] => | titul = ‘It’s insane’: New viruslike entities found in human gut microbes [156] => | periodikum = Science [157] => | vydavatel = American Association for the Advancement of Science [158] => | datum_vydání = 2024-01-26 [159] => | issn = 0036-8075 [160] => | datum_přístupu = 2024-01-29 [161] => | jazyk = anglicky [162] => | doi = 10.1126/science.znxt3dk [163] => | poznámky = online před tiskem [164] => }}{{Citace elektronického periodika [165] => | příjmení1 = Mihulka [166] => | jméno1 = Stanislav [167] => | titul = Podivuhodné RNA obelisky představují novou úroveň organismů [168] => | periodikum = O.S.E.L. [169] => | datum_vydání = 2024-01-28 [170] => | url = https://www.osel.cz/13310-podivuhodne-rna-obelisky-predstavuji-novou-uroven-organismu.html [171] => | issn = 1214-6307 [172] => | datum_přístupu = 2024-01-29 [173] => }} [174] => [175] => == Odkazy == [176] => === Reference === [177] => [178] => [179] => === Literatura === [180] => * HADIDI, Ahmed a RANDLES, John W. Viroids, and the Legacy of Ricardo Flores (1947–2020). ''Cells.'' 2021, vol. 10, no. 10, s. 2570. (This article belongs to the S'''pecial Issue Celebrating 50 Years of Viroid Discovery.''' Published 28 September 2021.) https://doi.org/10.3390/cells10102570 [181] => * LHOTSKÝ, Josef. ''Úvod do studia symbiotických interakcí mikroorganismů: nový pohled na viry a bakterie.'' 1. vyd. Praha: Academia, 2015. 207 s. Průhledy, sv. 13. ISBN 978-80-200-2480-0. [182] => * OWENS, Robert A. a HADIDI, Ahmed. The Remarkable Legacy of Theodor O. Diener (1921–2023): Preeminent Plant Pathologist and the Discoverer of Viroids. ''Viruses.'' 2023, vol. 15, no. 9, s. 1895. (This article belongs to the '''Special Issue Viroids and Satellites and Their Vector Interactions—This Special Issue Is Dedicated to the Memory of Theodor O. Diener Who Discovered Viroids'''. Published 8 September 2023.) https://doi.org/10.3390/v15091895 [183] => * SELINGER, Martin. ''Infekční systém pro studium mechanismů viroidní patogeneze.'' České Budějovice, 26. 1. 2008. 24 s. Středoškolská odborná činnost 2007/2008. Obor 4 – Biologie. Odborný ved. RNDr. Jaroslav Matoušek, CSc. Gymnázium J. V. Jirsíka, České Budějovice. Dostupné také z: http://soc.nidv.cz/archiv/getWork/hash/40C04MS240988A [184] => [185] => === Externí odkazy === [186] => * [https://www.mdpi.com/2073-4409/10/10/2570 o Ricardovi Floresovi] [187] => * [https://www.mdpi.com/1999-4915/15/9/1895 o Theodoru Ottovi Dienerovi] [188] => * {{Commonscat}} [189] => [190] => {{Typy RNA}} [191] => {{Autoritní data}} [192] => [193] => [[Kategorie:Nebuněčné organismy]] [] => )
good wiki

Viroid

Viroid je malá infekční cirkulární autokatalytická ribonukleová kyselina (RNA) nekódující žádný protein. Hostiteli viroidů jsou vyšší rostliny, u kterých viroidy způsobují onemocnění podobná virózám.

More about us

About

Expert Team

Vivamus eget neque lacus. Pellentesque egauris ex.

Award winning agency

Lorem ipsum, dolor sit amet consectetur elitorceat .

10 Year Exp.

Pellen tesque eget, mauris lorem iupsum neque lacus.

You might be interested in

,'Bílkovina','Virus','RNA polymeráza','pre-mRNA','genom','brambor','Filipíny','rajče','pyl','viroid CCCV','viroid PSTV','Soubor:PSTviroid.png'

Bílkovina

Bílkovina je jedním z nejdůležitějších živin v lidské stravě.

Filipíny

Genom

Pyl

Virus